سلام
سرورهای ویندوز دارای سیستم عامل ویندوز سرور بوده و از زبان برنامه نویسی asp.net و بانک اطلاعاتی sql server پشتیبانی می کنه و سرورهای لینوکس دارای سیستم عامل لینوکس بوده و از زبان برنامه نویسی php و بانک اطلاعاتی my sql پشتیبانی می کنه
صد البته که سرور های لینوکس چه از نظر امنیت و چه از نظر امکانات و ...بهتره
من به شخصه سرور لینوکس رو پیشنهاد میکنم
اگر هم لینوکس ندارین میتونین از نرم افزار هایی که سرور مجازی لینوکس ایجاد میکنن استفاده کنین.
نمونه ی این نرم افزار زمپ و ومپ سرور هستش.