تعدا پوشه ها متغییر و بر اساس component های نصب شده هست :
mailroot : برای ذخیره کردن میل ها و کارهای مربوط به smtp server هست
wwwroor: مربوط به کارهای وب سروری می شه. معمولا وب سایت ها رو توی این شاخه قرار می دن
AdminScripts: صفحات مربوط به کارهای مدیریتی. مثل مدیریت frontpage extension. و احتمالا یه سری اسکریپ برای نصب component های اضافه تر.
ftproot: برای مدیریت ftp server استفاده می شه.
متاسفانه خود مایکروسافت هم document دقیقی از این فولدرها و کاربرد هاشون ارائه نداده و فقط به documnent کردن فولدر های wwwroot، ftproot و mailroot اون هم خیلی مختصر بسنده کرده.