راه خوبیه!تنها روشی که به ذهنم میرسه :
تو صفحه ی انتخاب فایل یه اسکریپت بنویس با کلیک روی + یه فیلد اضافه کنه با یک اسم مشخص ، برای مثال فیلد اول اسمش هست up1 فیلد دوم بشه up2 و ... موقع دریافت تو فایل php یه حلقه بزار دونه دونه چک کنه که اگر ارسال شده بودن آپلودشون کنه در غیر این صورت با break از حلقه خارج شو ...