اگر منظورتان از دستورات MS-DOS آنهایی است که در پنجره Command Prompt ویندوز قابل اجرا هستند (مثل فرامین کنسولی ویندوز مانند Dir و سایر برنامه های کنسولی)
بله، اجرا می شوند.
صرفا یکسری برنامه های کنسولی قدیمی (مثل Commandline CD player و یا بعضی فرمان های منسوخ ویندوز (مثل fdisk) هستند که در ویندوز های مدرن
(حتی قبل تر از عرضه ویندوز 8) و یا در ویندوز های 64 بیتی (برنامه های 16 بیتی در ویندوز های 64 بیتی اجرا نمی شوند) قابل اجرا نیستند.